はるか昔、利害の一致によって結びついた植物と菌類。養分の受け渡しを行う菌根は、地球上でもっとも普遍的な共生の舞台となった。森林形成のカギとなる外生菌根菌ネットワーク、菌根菌と宿主樹木の共進化、新種の国産トリュフ、ツツジ科の生存を支えるエリコイド菌根菌、木材腐朽菌に寄生する菌従属栄養植物、共生を開始させるシグナル物質、アーバスキュラー菌根菌が形成する樹枝状体の崩壊など、気鋭の研究者１２名がさまざまな角度から根菌の謎を解き明かす。

序章　菌根とは何か（齋藤雅典）
第１章　木を育て、森をつくるキノコの力―菌根ネットワークと土に眠る胞子（奈良一秀）
第２章　地下に隠れた菌根性キノコ・トリュフを探る（木下晃彦）
第３章　エリコイド菌根の世界―ツツジ科で生まれた謎に満ちた共生関係（馬場隆士・広瀬大）
第４章　光合成をやめた不思議な植物「菌従属栄養植物」をめぐる冒険（末次健司）
第５章　菌根共生の鍵となる物質を探して―ストリゴラクトンの発見とその後の展開（秋山康紀）
第６章　根粒共生から菌根共生を探る（齋藤勝晴）
第７章　菌根の働きを見る―植物側から見てみると（小八重善裕）
第８章　ラン菌根の共生発芽を探る（久我ゆかり）
第９章　菌根菌ではないけれど植物ときってもきれない関係のＤＳＥ（成澤才彦）