「ずいぶん楽しかったみたいだね、いのり〜」桃原グループの御曹司・桃原誓護は、最愛の妹・祈祝のためにフルート教室を訪れていた。相変わらず妹を溺愛する誓護。紹介してくれた誓護のクラスメイト・折笠美赤の眼差しもかなり冷たい…。その美赤の前に新たな教誨師・ギシギシが現れた！教誨師が現れたと言うことは、美赤は罪人！？そんなバカな！？美赤の無実を確信する誓護は、彼女を護ってギシギシと対決する―。一方、アコニットも『不自然に劣化した残滓条痕』を調査するため、再び現世に現れていた。しかし、誓護が美赤とともに行方不明に！彼女は微かな手がかりを辿り、誓護の行方を捜すが…。