体内に“賢者の石”を埋め込まれ、オーヴァードとして覚醒した高校生・七村紫帆。石によってさまざまな事件に巻き込まれた彼女は、ついにその秘密を追うことを決意する。手がかりを追って豪華客船にまで乗り込む紫帆たち。だが、艱難辛苦の末に見えてきたのは驚くべき紫帆の過去だった。その過去は本当に自分のものなのか。それとも何かの陰謀なのか。みずからの真実を知るために、紫帆は仲間たちと“賢者の石”に、そして自分自身に立ち向かう。