東京武偵高校、そこは武力を行使する探偵――通称『武偵』を育成する特殊な学校。強襲科の超エリートでＳランクの最強武偵・アリアと、そのパートナーに選ばれてしまった（普段は）ただの一般人・遠山キンジの前に、『武偵殺し』の名を持つ理子が現れ、謎の組織イ・ウーから理子の宝物を取り返す作戦に協力することになってしまう。後日、超能力捜査研究科(SSR)の白雪がキンジに「狼と鬼と幽霊に会う」という不思議な占いの結果を伝える。この言葉が指す意味とは――。