超潜須佐之男号南米秘密要塞へ帰還しようとした敵旗艦ワグナーの撃沈に成功した。さらに独軍の最新暗号ブックを入手し、驚愕の事実が発覚した。丸裸になった独軍の通信内容により判明したのは独軍が秘密裡に建造した核研究所、製造工場の不気味な存在だった。魔王の核攻撃を阻止するため、後世日本軍は総力を結集し、原爆工場破壊作戦を敢行しようとしていた。