リロは、おねえさんとふたりで、ハワイのしまでくらしています。ともだちとけんかばかりしているリロが、こいぬをかうことになりました。ところが、スティッチとなづけられたペットは、いぬではなく、きょうぼうなエイリアンだったのです。

両親を失ったさびしがりやの女の子、リロのもとに、宇宙から暴れん坊の逃亡者スティッチがやってきた。ハワイを舞台に、２人の感動の物語がはじまる……。