スパデプの物語は前途多難！？今度は二人が…パパになる！？現代と未来の時間軸が交錯し、邂逅した若きスパイダーマンとデッドプール、そしてパーカー爺とウィルソン爺。老いたデッドプールは突如現れた自身のクローン、偽プール集団からなんとか逃れることができた。しかし、敵であるはずの奴らは自身を造ったカメレオンに反旗を翻し、創造者マスター・マトリクスを復活させてしまったのだ！デッドプールは、スパイダーマンを半身不随にした張本人である偽プール集団を殺そうと考える。しかし、戦いの途中、ひょんなことからマスター・マトリクスを正しく導く「パパ」になることに！？スパイダーマンとデッドプール、二人の子育て物語が始まる！