体が小さくなる特殊スーツを着て、地中探検をすることになったジオたち。静かな所だと思っていた土の下は、直接入ってみると、ミミズやモグラなどよく知っている生物はもちろん、名前も知らない小さな虫などたくさんの生物が暮らしていた！草食か肉食か、天敵は何かなど、その生態を知らないと、この危機から逃れることはできない？！

１章　ノウ博士の友人
２章　怪しげな実験室
３章　地中探検に出発！
４章　穴の中の大食漢、モグラ
５章　謎の虫たち
６章　ダニＶＳジリス
７章　地中に雨が降る？
８章　ジャンプの達人、コメツキムシ
９章　アリの巣穴に避難せよ！

地中探検をするジオたちだったが、次々とトラブルが襲う。脱出するには、地中生物の生態を知らなければならない。