魔帯箱を形にし二年生へと進級したクノンは、憧れのサトリ先生のフィールドワークに同行、早速波乱を巻き起こす。さらに、森林化が進んだ学園地下の迷宮で、神話上の植物と思しきものの目撃情報が！教師陣を中心にした捜索隊が急遽結成される中、クノンもそこに抜擢され―？特級クラスの後輩に新たに加わったジオエリオンの従妹もすぐさま魔術沼に引きずり込んで、さらに賑やかに加速する盲目の天才の魔術探求・二年生編スタート！