あらゆる願いを叶えるといわれる聖杯を賭けて戦う殺し合いの儀式「聖杯戦争」―１９９１年に起きた本戦において、沙条愛歌はセイバーと契約し、敵対する他の陣営を圧倒していた。他方、極東随一の魔術師の家系である玲瓏館家は、魔術師１０００年の大願である「根源」へ至るため、現当主が聖杯戦争に参加。歴代当主の中でも特に優秀とされ、娘・美沙夜の誇りである彼は、満を持してサーヴァントと契約するのだが―。