銀河はここ百年以上戦争状態が続いている。魔法少女〈レジーナ☆レーナ〉と共に〈羊飼い〉レイとの激戦を繰り広げた守護精霊のシン。激戦の末、レイと刺し違え長い眠りについていたシンだったが目を覚ますとそこには、見知らぬ魔法少女が−−。本編では描かれない世界線で戦い続ける者達のストーリーが今ここに！！