全国に九つある魔法師育成機関「魔法科高校」。司波深雪は、その中でも一番のエリート校・第一高校に主席入学した、容姿端麗で完全無欠な優等生。入学早々、歴代主席の慣例にならって、生徒会メンバーに選任された深雪。一方、深雪の兄の達也もひょんなことから、落ちこぼれの二科生としては史上初の風紀委員に選ばれるのだった。優等生の妹と劣等生の兄――ふたりの存在は日に日に周囲に耳目をを集め始める。そんな中、数々のクラブ活動がしのぎを削る春の一大イベント「新入部員勧誘週間」の幕が開ける！