８００ｋｍの行軍を成し遂げ、無事“エラー５１７”を克服した秋人とフィリアたち。しかし休む間もなく、彼らの元へ正体不明の“声”が届く。『―たすけて』と救いの手を求めるその人物は、全ての始まりとなったシステム“アルカディア”の開発者にして、秋人たちをここまで導いた“ＪＵＮＯ”だった―。救出した彼女の口から明かされたのは、“死を超越した子供たち”の秘密と“アルカディア”完全破壊の方法。全てを終わらせるため、向かうはテレサ社の本拠地、楽園都市・ティーラ。そして“ＪＵＮＯ”の真の目的を知った秋人は、ある決意を胸に最後の戦いへと身を投じる！