神主だったおじいちゃんが亡くなって、おばあちゃんが一人で守っている那木野神社と那木野の森。神社のご神体とこの森には「大蛇の伝説」という悲しい言い伝えがあった。夏休みにやってきた優は、森で出会った不思議な少年ミチルと白い子犬のイツキとともに、森を脅かすものに立ち向かうことに…。