第１章　コンピュータで分子の形をみるために―その基本的考え方（分子力場とは
分子のコンピュータシミュレーション
分子力学計算の長所と欠点）
第２章　分子力学計算（分子力学計算のなりたち
分子力学計算で使用される分子力場の基本理論―アリンジャーの分子力場を中心として
分子力場からコンピュータを使って理論的に計算できること）
第３章　分子力場の応用例（分子力学計算の応用例
分子動力学計算の応用例
分子力場計算の現状と今後の展望）