女性にしか反応しない兵器＜ＩＳ＞を、なぜか男なのに起動させられる一夏は、その操縦者を育成するための学校・ＩＳ学園に入学することに。一夏たちの活躍により、謎の機体による学園襲撃事件に決着がついて間もなく、箒は意を決して想いをうちあける。そんな中、銀髪の少女と男子生徒という二人の転校生が現れて――。