ウォーカー中尉をリーダーとするＳＥＡＬチームは北朝鮮への潜入には成功するが、核魚雷を発見することはできず、ミッションは失敗した。一方、核魚雷を入手したウリザムは、フィリピン南西部の沖合にある“危険水域”と呼ばれる大航海時代以来の難所で、米国海軍の原子力潜水艦を強奪すべく身を潜めていた。核魚雷で東京を壊滅させ、その世界的混乱に乗じイスラム統一国を建国するのだ！果たしてその野望の行方は…！？