舞台は、日本海に面する、とある“港町”。市場をまとめる吹雪水産の社長を務めるのは女子高生の氷川晶。しかし、その真の姿は、ヤクザである吹雪組の組長代理であった。シマを奪おうと暗躍するヤクザ、勢力拡大を企む大陸マフィア、マグロや船員を狙う海賊、そして謎の巨大犯罪組織―日本海の荒波のごとく、次々と押し寄せる難局。孤児のガンマン“モーゼル・キッド”ジュン。“親殺し”の汚名を着せられたヤクザ、秋月。無骨で愚直な刑事、山田といった仲間とともに、荒波を乗り越え、晶は先代から受け継いだ組を守ることができるのか！？