消えた弟を探すため、不思議な事件を扱うという双子・晴と嵐を訪ねた莉莉。弟と再会するなかで、彼女は事件の原因が傷ついた“あやかし”だと知り、そんな存在を癒す『お医者さん』の双子に弟子入りをすることになる。弟子として莉莉が双子やあやかしのことを知っていくうちに、季節は秋。彼女の学校は文化祭の準備でにわかに騒がしくなっていた。莉莉もまたクラス展示の調査のために、街の図書館へと訪れるのだが、そこで彼女は本から文字が消えていくという奇妙な出来事に遭遇し…？