日本列島を東西に分断する裂け目、フォッサ・マグナ。そこに眠る古代の化石群が１つに結集し、巨大な妖怪獣へと姿を変えた。向かう先は東京。人間には天災にしか見えない襲来に、妖怪たちだけが真相と行く末に気づいていた。このままでは世界が滅んでしまう。止められるのは、伝説の妖怪ハンター、渡辺綱の血を継ぐ小学生・渡辺兄―。突然“世界を救う勇者”に選ばれた少年と、彼を巻き込んだ妖怪たちの大冒険が今始まる！