壮絶をきわめた敵異星船との死闘から４年後、“ファージ”と名づけられた有機生命体に対し、人類は反撃を開始した。だが、シーアン星系に派遣された地球連合艦隊は、敵の巨大船により次々と撃破されてゆく。その劣勢を救ったのは、新造駆逐艦“アレス”艦長のウルフ率いる第九戦隊の到着だった。その活躍により戦況は一変、損傷した巨大船は逃亡し、ウルフは跡を追うが、その船が逃げこんだ星系は敵の一大集結地だった！